Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+對含C:T錯配的DNA序列識別作用的分子模擬研究

通過分子模擬方法研究了手性金屬配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+ ( bpy=2,2'-bipyridine; Chrysi= 5,6- chrysenequinonediimine )對包含C:T 錯配堿基對的B-DNA序列的識別作用.結(jié)合類似的針對含G:A錯配的和正常的B-DNA序列的識別作用研究,發(fā)現(xiàn)配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+可以對錯配B-DNA序列進行序列特異性的識別.能量對比計算結(jié)果表明,該經(jīng)典插入識別作用傾向于在錯配堿基對附近進行,其中Δ - [Rh(bpy)2chrysi]3+比其手性異構(gòu)體更占優(yōu)勢.這同Barton教授工作組的實驗結(jié)果是一致的.另外插入作用傾向于在錯配序列中的正常雙堿基對C3A4/G3T4(錯配堿基對附近)中從小溝進行.與該配合物對含G:A錯配的和正常的B-DNA序列的識別作用不同的是,對包含C:T 錯配堿基對的B-DNA序列的識別作用傾向于從小溝進行.這一點可能源于C:T堿基對結(jié)構(gòu)的不同.

作 者： 熊振海 楊頻 XIONG Zhen-hai YANG Pin   作者單位： 熊振海,XIONG Zhen-hai(山西大學分子科學研究所,分子生物學和分子工程教育部重點實驗室,山西,太原,030006;上海交通大學化學化工學院,上海,200240)

楊頻,YANG Pin(山西大學分子科學研究所,分子生物學和分子工程教育部重點實驗室,山西,太原,030006) 

刊 名： 分子科學學報  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCE  年，卷(期)： 2006 22(3)  分類號： Q52  關(guān)鍵詞： 分子模擬   ESFF   C:T錯配DNA   金屬配合物  

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